Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIAQ12857 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFIAQ12857 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFIAQ12857 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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