Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FOXO1Q12778 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXO1Q12778 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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