Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 YLR339CYLR339C 552 nt3.36□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.36□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 MRPL17YNL252C 846 nt3.36□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 YOR062CYOR062C 807 nt3.36□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 STP1YDR463W 1560 nt3.36□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 GCD2YGR083C 1956 nt3.36□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 CDC5YMR001C 2118 nt3.35□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 SEC2YNL272C 2280 nt3.35□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 HSP30YCR021C 999 nt3.35□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 MSW1YDR268W 1140 nt3.35□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 SRB7YDR308C 423 nt3.35□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.35□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 SCM4YGR049W 564 nt3.35□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 DLT1YMR126C 1029 nt3.35□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 PEX15YOL044W 1152 nt3.35□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 RAS1YOR101W 930 nt3.35□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 ASI1YMR119W 1875 nt3.35□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 TMA108YIL137C 2841 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 TMA17YDL110C 453 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 YDL228CYDL228C 642 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 PET100YDR079W 336 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 YDR149CYDR149C 708 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 YDR431WYDR431W 312 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 RPB3YIL021W 957 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 CCE1YKL011C 1062 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 COQ9YLR201C 783 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 YBL010CYBL010C 843 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 YMR087WYMR087W 855 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 RPB8YOR224C 441 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 SLX1YBR228W 915 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 FYV5YCL058C 459 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 COM2YER130C 1332 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 SAD1YFR005C 1347 nt3.34□□□□□ -1.87
VAM3Q12241 YBR225WYBR225W 2703 nt3.34□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YOR022CYOR022C 2148 nt3.34□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 CHK1YBR274W 1584 nt3.34□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 STU1YBL034C 4542 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 BAR1YIL015W 1764 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 DPP1YDR284C 870 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 VFA1YER128W 612 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 MPS2YGL075C 1164 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 RGI2YIL057C 495 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 SOP4YJL192C 705 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YKL131WYKL131W 522 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YKT6YKL196C 603 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 SPC2YML055W 537 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YNL181WYNL181W 1224 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YOL106WYOL106W 354 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 BTS1YPL069C 1008 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 AI4Q0065 1671 nt3.33□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 HOM2YDR158W 1098 nt3.32□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 STE14YDR410C 720 nt3.32□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YFR057WYFR057W 456 nt3.32□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 UBC12YLR306W 567 nt3.32□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 SRT1YMR101C 1032 nt3.32□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 SFG1YOR315W 1041 nt3.32□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 PNG1YPL096W 1092 nt3.32□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YBR116CYBR116C 528 nt3.32□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 GCN5YGR252W 1320 nt3.32□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 SLY41YOR307C 1362 nt3.32□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 SPT14YPL175W 1359 nt3.32□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 EXO70YJL085W 1872 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 ITT1YML068W 1395 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 MAG1YER142C 891 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 SPT2YER161C 1002 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YGL230CYGL230C 444 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YGL242CYGL242C 546 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 FOL2YGR267C 732 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 PCD1YLR151C 1023 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 MIC27YNL100W 705 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 TOP1YOL006C 2310 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 VIP1YLR410W 3441 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 FAT1YBR041W 2010 nt3.31□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 ZDS1YMR273C 2748 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 ERG5YMR015C 1617 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 ATG21YPL100W 1491 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 MGT1YDL200C 567 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 RUB1YDR139C 234 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YDR526CYDR526C 471 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 SEC53YFL045C 765 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 VMA7YGR020C 357 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 BET5YML077W 480 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 ECM16YMR128W 3804 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 NIS1YNL078W 1224 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 snR11snR11 258 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 FDH2YPL275W 711 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 RAD4YER162C 2265 nt3.3□□□□□ -1.88
VAM3Q12241 RSF2YJR127C 4143 nt3.29□□□□□ -1.88
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