Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 DLS1YJL065C 504 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 MBR1YKL093W 1020 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 IMP1YMR150C 573 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 PFK27YOL136C 1194 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 PSF3YOL146W 585 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 CCL1YPR025C 1182 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 snR44snR44 211 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YLR278CYLR278C 4026 nt3.72□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 YVC1YOR087W 2028 nt3.71□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 ETP1YHL010C 1758 nt3.71□□□□□ -1.81
LSP1Q12230 RPL35BYDL136W 363 nt3.71□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 ERJ5YFR041C 888 nt3.71□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YML053CYML053C 639 nt3.71□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 TRI1YMR233W 681 nt3.71□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 SYC1YOR179C 567 nt3.71□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 FKH2YNL068C 2589 nt3.71□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 CET1YPL228W 1650 nt3.71□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 AGA1YNR044W 2178 nt3.7□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 CIN8YEL061C 3003 nt3.7□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 CBS2YDR197W 1170 nt3.7□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YPR1YDR368W 939 nt3.7□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 KXD1YGL079W 657 nt3.7□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 RFA3YJL173C 369 nt3.7□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 FIP1YJR093C 984 nt3.7□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 END3YNL084C 1050 nt3.7□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YOL107WYOL107W 1029 nt3.7□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 SSE2YBR169C 2082 nt3.7□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 MIC60YKR016W 1623 nt3.7□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YOS1YER074W-A 258 nt3.69□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.69□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 PSF2YJL072C 642 nt3.69□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YKR070WYKR070W 1059 nt3.69□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 GPN3YLR243W 819 nt3.69□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 RPS28BYLR264W 204 nt3.69□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 MED11YMR112C 396 nt3.69□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 RPB8YOR224C 441 nt3.69□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 HSH49YOR319W 642 nt3.69□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 ERG9YHR190W 1335 nt3.69□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 PLM2YDR501W 1566 nt3.68□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 ACA1YER045C 1470 nt3.68□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 RPS18AYDR450W 441 nt3.68□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 PFS1YHR185C 714 nt3.68□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.68□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.68□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 IPP1YBR011C 864 nt3.68□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YOR263CYOR263C 408 nt3.68□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 PDR12YPL058C 4536 nt3.68□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 VPS27YNR006W 1869 nt3.68□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 MNR2YKL064W 2910 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YSP2YDR326C 4317 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 RAD4YER162C 2265 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 MSB2YGR014W 3921 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 SNU23YDL098C 585 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 RPC11YDR045C 333 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 MEI4YER044C-A 1227 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YFR057WYFR057W 456 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 COS1YNL336W 1146 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 TYE7YOR344C 876 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 MCM16YPR046W 546 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YHR202WYHR202W 1809 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 COM2YER130C 1332 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YOR296WYOR296W 3870 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 PRS5YOL061W 1491 nt3.67□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 NMD2YHR077C 3270 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 JJJ1YNL227C 1773 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 DOA4YDR069C 2781 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 TCP1YDR212W 1680 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 MGT1YDL200C 567 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YHI9YHR029C 885 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 DUG3YNL191W 1074 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 TAZ1YPR140W 1146 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 MED8YBR193C 672 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 ENA2YDR039C 3276 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 ENA1YDR040C 3276 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 CHK1YBR274W 1584 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 YPS6YIR039C 1614 nt3.66□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 VPS17YOR132W 1656 nt3.65□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 UBP12YJL197W 3765 nt3.65□□□□□ -1.82
LSP1Q12230 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YGL204CYGL204C 306 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 CAB2YIL083C 1098 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YLR339CYLR339C 552 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 RPN13YLR421C 471 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YMR099CYMR099C 894 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 SRT1YMR101C 1032 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YNL035CYNL035C 1170 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YOR186WYOR186W 435 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 RPL20BYOR312C 519 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 RPS11BYBR048W 471 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 NIP7YPL211W 546 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 USV1YPL230W 1176 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YBR116CYBR116C 528 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 RRN7YJL025W 1545 nt3.65□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 NOP4YPL043W 2058 nt3.64□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 ORC4YPR162C 1590 nt3.64□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 IZH1YDR492W 951 nt3.64□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 YDR535CYDR535C 501 nt3.64□□□□□ -1.83
LSP1Q12230 ERV29YGR284C 933 nt3.64□□□□□ -1.83
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