Protein–RNA interactions for Protein: Q12112

TY1B-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-NL1Q12112 WHI4YDL224C 1950 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-NL1Q12112 OPT2YPR194C 2634 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-NL1Q12112 BNA4YBL098W 1383 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-NL1Q12112 CIR1YGR207C 786 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1B-NL1Q12112 PBA1YLR199C 831 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1B-NL1Q12112 RSM19YNR037C 276 nt3.15□□□□□ -1.9
TY1B-NL1Q12112 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 MSH4YFL003C 2637 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 RTT107YHR154W 3213 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 PIP2YOR363C 2991 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 ISC10YER180C 804 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 SWC7YLR385C 399 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 CTF4YPR135W 2784 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 DEF1YKL054C 2217 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 YGL159WYGL159W 1113 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 YKL131WYKL131W 522 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 KHA1YJL094C 2622 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 PRP8YHR165C 7242 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 EMI1YDR512C 564 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 snR83snR83 306 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 ECM1YAL059W 639 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 PFY1YOR122C 381 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 RFC5YBR087W 1065 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 YBR259WYBR259W 2067 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 TOR1YJR066W 7413 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 PEP7YDR323C 1548 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 STE14YDR410C 720 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 RCY1YJL204C 2523 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 APN2YBL019W 1563 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 BPT1YLL015W 4680 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 VPS27YNR006W 1869 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 TAF6YGL112C 1551 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 FYV12YOR183W 390 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 KAR5YMR065W 1515 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 KAP95YLR347C 2586 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 RPL25YOL127W 429 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1B-NL1Q12112 SKM1YOL113W 1968 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 BUD2YKL092C 3315 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 SBE22YHR103W 2559 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 ALG14YBR070C 714 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 HRD3YLR207W 2502 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 HRD1YOL013C 1656 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 ELP3YPL086C 1674 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 ARD1YHR013C 717 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 ATG19YOL082W 1248 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 PDS1YDR113C 1122 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 NSA1YGL111W 1392 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 ECM5YMR176W 4236 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 SAT4YCR008W 1812 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 SQS1YNL224C 2304 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 MYO4YAL029C 4416 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 FMP10YER182W 735 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 RPS7AYOR096W 573 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 SEC6YIL068C 2418 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 TRM3YDL112W 4311 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 DYN2YDR424C 279 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 MRP8YKL142W 660 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 PML39YML107C 1005 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 HST2YPL015C 1074 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 FAS1YKL182W 6156 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 YBR139WYBR139W 1527 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 YDR149CYDR149C 708 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 YHR210CYHR210C 1026 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 YPR053CYPR053C 456 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1B-NL1Q12112 THO1YER063W 657 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 PDX1YGR193C 1233 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 YHL045WYHL045W 348 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 YKT6YKL196C 603 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 DGR1YNL130C-A 147 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 YPL088WYPL088W 1029 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 YAR009CYAR009C 3591 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 YER133W-AYER133W-A 342 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 NVJ1YHR195W 966 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 OAF3YKR064W 2592 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 ISM1YPL040C 3009 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 ARP7YPR034W 1434 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 RPN4YDL020C 1596 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 PUT2YHR037W 1728 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 UBP6YFR010W 1500 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 IXR1YKL032C 1794 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 YAT2YER024W 2772 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 AMS1YGL156W 3252 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 YDR249CYDR249C 1122 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 YKL091CYKL091C 933 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 RPL36AYMR194W 303 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 DUG3YNL191W 1074 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 COS111YBR203W 2775 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 PTR3YFR029W 2037 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 YHR177WYHR177W 1362 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 UTP15YMR093W 1542 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 RPS28BYLR264W 204 nt3□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 ISU1YPL135W 498 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1B-NL1Q12112 UBP2YOR124C 3819 nt2.99□□□□□ -1.93
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