Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IFFO1Q0D2I5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFFO1Q0D2I5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms