Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF4Q08170 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF4Q08170 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms