Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms