Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YLR177W	YLR177W	1887 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YPR148C	YPR148C	1308 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	VFA1	YER128W	612 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	SPT15	YER148W	723 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YGR270C-A	YGR270C-A	219 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YHL026C	YHL026C	948 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	HTD2	YHR067W	843 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	MRPL49	YJL096W	486 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	GSP1	YLR293C	660 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	REH1	YLR387C	1299 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	TPM1	YNL079C	600 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	IRC13	YOR235W	315 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YBR292C	YBR292C	372 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	SUC2	YIL162W	1599 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	ORC4	YPR162C	1590 nt		3.8	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	PFS1	YHR185C	714 nt		3.79	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	POG1	YIL122W	1056 nt		3.79	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	SSU72	YNL222W	621 nt		3.79	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	YOL162W	YOL162W	648 nt		3.79	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	IMD4	YML056C	1575 nt		3.79	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	GYP6	YJL044C	1377 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	RPN2	YIL075C	2838 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	NRP1	YDL167C	2160 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	TSC13	YDL015C	933 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	SNU23	YDL098C	585 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	FSH1	YHR049W	732 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	SOD1	YJR104C	465 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	BOS1	YLR078C	735 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	LDS2	YOL047C	1071 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	RPA43	YOR340C	981 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	CCL1	YPR025C	1182 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	RRN7	YJL025W	1545 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	SLI1	YGR212W	1407 nt		3.78	□□□□□ -1.8
MRD1	Q06106	FLO9	YAL063C	3969 nt		3.78	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	RRP5	YMR229C	5190 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	ECM18	YDR125C	1362 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	DTD1	YDL219W	453 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	PSF1	YDR013W	627 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	STE14	YDR410C	720 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YGL214W	YGL214W	486 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YAR075W	YAR075W	474 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	SHH3	YMR118C	591 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	DCP1	YOL149W	696 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	NIP7	YPL211W	546 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YOL019W	YOL019W	1656 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	PRM15	YMR278W	1869 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	SST2	YLR452C	2097 nt		3.77	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	ETP1	YHL010C	1758 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	TSR1	YDL060W	2367 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	CAF130	YGR134W	3369 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YDR034C-C	YDR034C-C	1317 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YLR410W-A	YLR410W-A	1317 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	SQS1	YNL224C	2304 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	WBP1	YEL002C	1293 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	COX23	YHR116W	456 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YJR128W	YJR128W	360 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	NEJ1	YLR265C	1029 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	GOT1	YMR292W	417 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	HNT3	YOR258W	654 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	snR42	snR42	351 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	REC8	YPR007C	2043 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	MAK11	YKL021C	1407 nt		3.76	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	RTT109	YLL002W	1311 nt		3.75	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YHR202W	YHR202W	1809 nt		3.75	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	VPS25	YJR102C	609 nt		3.75	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	ENT3	YJR125C	1227 nt		3.75	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YKT6	YKL196C	603 nt		3.75	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YLR285C-A	YLR285C-A	171 nt		3.75	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	TRM112	YNR046W	408 nt		3.75	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	UFE1	YOR075W	1041 nt		3.75	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	ALG1	YBR110W	1350 nt		3.75	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YMR018W	YMR018W	1545 nt		3.75	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YNR066C	YNR066C	1311 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	SUP45	YBR143C	1314 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	ISM1	YPL040C	3009 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YHR080C	YHR080C	4038 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YHR180W	YHR180W	492 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YAL004W	YAL004W	648 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	MAK16	YAL025C	921 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	FIG1	YBR040W	897 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YPR078C	YPR078C	1119 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YLR352W	YLR352W	2424 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	TMA108	YIL137C	2841 nt		3.74	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	PBI1	YPL272C	1554 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	AUS1	YOR011W	4185 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YDL032W	YDL032W	312 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	PIB1	YDR313C	861 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	MEI4	YER044C-A	1227 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	AML1	YGR001C	747 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	IRC18	YJL037W	675 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	TVP18	YMR071C	504 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	SMC3	YJL074C	3693 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	THR4	YCR053W	1545 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	BCS1	YDR375C	1371 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	RTG3	YBL103C	1461 nt		3.73	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	GPI1	YGR216C	1830 nt		3.72	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	FAP7	YDL166C	594 nt		3.72	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms