Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SRSF11Q05519 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF11Q05519 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms