Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN12Q05209 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms