Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GBE1Q04446 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBE1Q04446 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms