Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID5AQ03989 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARID5AQ03989 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms