Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN2Q02246 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN2Q02246 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms