Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BEX3Q00994 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BEX3Q00994 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms