Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTRA4P83105 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTRA4P83105 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms