Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSNL1P62760 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSNL1P62760 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms