Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
RPS29P62273 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
RPS29P62273 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
RPS29P62273 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
RPS29P62273 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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