Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFM1P61960 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UFM1P61960 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFM1P61960 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFM1P61960 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFM1P61960 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFM1P61960 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFM1P61960 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFM1P61960 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFM1P61960 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFM1P61960 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFM1P61960 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFM1P61960 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFM1P61960 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFM1P61960 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFM1P61960 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
UFM1P61960 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UFM1P61960 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UFM1P61960 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UFM1P61960 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UFM1P61960 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UFM1P61960 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFM1P61960 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFM1P61960 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFM1P61960 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFM1P61960 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFM1P61960 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFM1P61960 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFM1P61960 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFM1P61960 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFM1P61960 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFM1P61960 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFM1P61960 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFM1P61960 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFM1P61960 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFM1P61960 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms