Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PRPS1P60891 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRPS1P60891 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRPS1P60891 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PRPS1P60891 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPS1P60891 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPS1P60891 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPS1P60891 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPS1P60891 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPS1P60891 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPS1P60891 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PRPS1P60891 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms