Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVFC1-1P60608 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFC1-1P60608 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms