Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCCD1P59942 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCD1P59942 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms