Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00315P59091 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms