Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00310P59036 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00310P59036 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms