Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA9P57773 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJA9P57773 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA9P57773 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA9P57773 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA9P57773 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA9P57773 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJA9P57773 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJA9P57773 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA9P57773 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA9P57773 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA9P57773 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA9P57773 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA9P57773 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA9P57773 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA9P57773 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJA9P57773 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJA9P57773 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJA9P57773 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms