Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB25P57735 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB25P57735 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB25P57735 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB25P57735 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB25P57735 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB25P57735 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB25P57735 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB25P57735 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB25P57735 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB25P57735 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB25P57735 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB25P57735 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB25P57735 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB25P57735 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB25P57735 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB25P57735 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB25P57735 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms