Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNQ4P56696 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNQ4P56696 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ4P56696 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms