Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL23P55773 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL23P55773 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL23P55773 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL23P55773 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCL23P55773 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL23P55773 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL23P55773 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCL23P55773 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCL23P55773 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCL23P55773 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCL23P55773 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCL23P55773 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCL23P55773 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL23P55773 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL23P55773 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL23P55773 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL23P55773 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL23P55773 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL23P55773 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL23P55773 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL23P55773 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL23P55773 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL23P55773 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms