Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GEMP55040 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GEMP55040 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GEMP55040 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEMP55040 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEMP55040 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEMP55040 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEMP55040 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEMP55040 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEMP55040 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEMP55040 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEMP55040 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEMP55040 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GEMP55040 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEMP55040 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEMP55040 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEMP55040 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEMP55040 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GEMP55040 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEMP55040 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEMP55040 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEMP55040 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEMP55040 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GEMP55040 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GEMP55040 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEMP55040 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEMP55040 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEMP55040 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEMP55040 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEMP55040 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEMP55040 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEMP55040 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEMP55040 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GEMP55040 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GEMP55040 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GEMP55040 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEMP55040 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GEMP55040 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEMP55040 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEMP55040 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEMP55040 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEMP55040 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEMP55040 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GEMP55040 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEMP55040 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEMP55040 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GEMP55040 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GEMP55040 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GEMP55040 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms