Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKAA2P54646 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKAA2P54646 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms