Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNB3P54284 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms