Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPAP53621 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPAP53621 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPAP53621 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPAP53621 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPAP53621 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPAP53621 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPAP53621 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPAP53621 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms