Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACLYP53396 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACLYP53396 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACLYP53396 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACLYP53396 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACLYP53396 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACLYP53396 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACLYP53396 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACLYP53396 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ACLYP53396 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACLYP53396 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACLYP53396 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACLYP53396 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACLYP53396 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACLYP53396 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACLYP53396 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACLYP53396 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACLYP53396 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACLYP53396 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACLYP53396 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACLYP53396 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACLYP53396 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACLYP53396 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACLYP53396 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms