Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SNT2	P53127	FRE4	YNR060W	2160 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SNT2	P53127	INO4	YOL108C	456 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SNT2	P53127	YBR209W	YBR209W	318 nt		3.35	□□□□□ -1.87
SNT2	P53127	MGM1	YOR211C	2646 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SNT2	P53127	MSA1	YOR066W	1890 nt		3.34	□□□□□ -1.87
SNT2	P53127	PDC2	YDR081C	2778 nt		3.34	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	ERG25	YGR060W	930 nt		3.34	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	SRT1	YMR101C	1032 nt		3.34	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	YAR1	YPL239W	603 nt		3.34	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	SQS1	YNL224C	2304 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	ESL1	YIL151C	3357 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	ETP1	YHL010C	1758 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	SIC1	YLR079W	855 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	SAS5	YOR213C	747 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	CLN2	YPL256C	1638 nt		3.33	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	ORM1	YGR038W	669 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	YKT6	YKL196C	603 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	SLM2	YNL047C	1971 nt		3.32	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	SRB8	YCR081W	4284 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	SER3	YER081W	1410 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	PEX6	YNL329C	3093 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	BET1	YIL004C	429 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	GLO1	YML004C	981 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	HSC82	YMR186W	2118 nt		3.31	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	TMC1	YOR052C	453 nt		3.3	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	PEX8	YGR077C	1770 nt		3.3	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	DOA4	YDR069C	2781 nt		3.3	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	YAE1	YJR067C	426 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	RPC34	YNR003C	954 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	TFA1	YKL028W	1449 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	BUD4	YJR092W	4344 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	ROM1	YGR070W	3468 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	SSF2	YDR312W	1362 nt		3.29	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	PFA5	YDR459C	1125 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	YDR535C	YDR535C	501 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	PEX4	YGR133W	552 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	VAC14	YLR386W	2643 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	BCH2	YKR027W	2298 nt		3.28	□□□□□ -1.88
SNT2	P53127	YJR098C	YJR098C	1971 nt		3.28	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	GAL80	YML051W	1308 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	RAD5	YLR032W	3510 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	SVL3	YPL032C	2478 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	MGT1	YDL200C	567 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	RPL27A	YHR010W	411 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	LSM8	YJR022W	330 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	YAL059C-A	YAL059C-A	423 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	YML053C	YML053C	639 nt		3.27	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	SRL3	YKR091W	741 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	RPS28B	YLR264W	204 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	RPS7A	YOR096W	573 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	snR3	snR3	194 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	TAE2	YPL009C	3117 nt		3.26	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	CDH1	YGL003C	1701 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	ORC4	YPR162C	1590 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	RPS23A	YGR118W	438 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	GAB1	YLR459W	1185 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	SIP18	YMR175W	240 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	RPS23B	YPR132W	438 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	TFC3	YAL001C	3483 nt		3.25	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	DAS2	YDR020C	699 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	MMM1	YLL006W	1281 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	RAS1	YOR101W	930 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	MSS18	YPR134W	807 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	ATG32	YIL146C	1590 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	IRC8	YJL051W	2469 nt		3.24	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	WHI4	YDL224C	1950 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	YFL015C	YFL015C	495 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	ERV1	YGR029W	570 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	MAC1	YMR021C	1254 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	YBL065W	YBL065W	345 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	FAS1	YKL182W	6156 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	BNA4	YBL098W	1383 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	ALG14	YBR070C	714 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	DUG2	YBR281C	2637 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	YBL005W-A	YBL005W-A	1323 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	YMR046C	YMR046C	1323 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	SIR4	YDR227W	4077 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	ENT1	YDL161W	1365 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	YIL092W	YIL092W	1902 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	DCP2	YNL118C	2913 nt		3.21	□□□□□ -1.89
SNT2	P53127	SPT2	YER161C	1002 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	YIR040C	YIR040C	333 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	TTI2	YJR136C	1266 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	GTR1	YML121W	933 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	YNL165W	YNL165W	1221 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	SET1	YHR119W	3243 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	HSH155	YMR288W	2916 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	DIS3	YOL021C	3006 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	TCP1	YDR212W	1680 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	NEO1	YIL048W	3456 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	SFB2	YNL049C	2631 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	SYS1	YJL004C	612 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	RSM19	YNR037C	276 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	RFC5	YBR087W	1065 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	SSD1	YDR293C	3753 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	ESC1	YMR219W	4977 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	RCY1	YJL204C	2523 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	NSA1	YGL111W	1392 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SNT2	P53127	ERG9	YHR190W	1335 nt		3.19	□□□□□ -1.9

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