Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX1P52954 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX1P52954 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX1P52954 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LBX1P52954 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX1P52954 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX1P52954 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX1P52954 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LBX1P52954 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX1P52954 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX1P52954 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX1P52954 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX1P52954 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX1P52954 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX1P52954 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LBX1P52954 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LBX1P52954 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX1P52954 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX1P52954 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX1P52954 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX1P52954 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX1P52954 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX1P52954 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX1P52954 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX1P52954 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX1P52954 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LBX1P52954 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LBX1P52954 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX1P52954 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX1P52954 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX1P52954 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX1P52954 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX1P52954 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX1P52954 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX1P52954 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX1P52954 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LBX1P52954 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBX1P52954 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBX1P52954 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBX1P52954 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBX1P52954 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBX1P52954 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBX1P52954 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBX1P52954 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBX1P52954 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LBX1P52954 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LBX1P52954 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LBX1P52954 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LBX1P52954 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LBX1P52954 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LBX1P52954 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LBX1P52954 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LBX1P52954 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LBX1P52954 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LBX1P52954 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LBX1P52954 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LBX1P52954 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms