Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EFNA4P52798 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EFNA4P52798 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms