Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRIP1P50238 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms