Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTCFP49711 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTCFP49711 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTCFP49711 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTCFP49711 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTCFP49711 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTCFP49711 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTCFP49711 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTCFP49711 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTCFP49711 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTCFP49711 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTCFP49711 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTCFP49711 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTCFP49711 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTCFP49711 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTCFP49711 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTCFP49711 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTCFP49711 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTCFP49711 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTCFP49711 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTCFP49711 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTCFP49711 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTCFP49711 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTCFP49711 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTCFP49711 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTCFP49711 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTCFP49711 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTCFP49711 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTCFP49711 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTCFP49711 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTCFP49711 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTCFP49711 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTCFP49711 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTCFP49711 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTCFP49711 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTCFP49711 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTCFP49711 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTCFP49711 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTCFP49711 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTCFP49711 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTCFP49711 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTCFP49711 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTCFP49711 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTCFP49711 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTCFP49711 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTCFP49711 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTCFP49711 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTCFP49711 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTCFP49711 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTCFP49711 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTCFP49711 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTCFP49711 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTCFP49711 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
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