Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNTAP49354 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNTAP49354 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNTAP49354 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FNTAP49354 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTAP49354 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTAP49354 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTAP49354 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTAP49354 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNTAP49354 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNTAP49354 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNTAP49354 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNTAP49354 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTAP49354 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTAP49354 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTAP49354 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTAP49354 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTAP49354 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTAP49354 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNTAP49354 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTAP49354 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTAP49354 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTAP49354 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTAP49354 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTAP49354 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTAP49354 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTAP49354 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTAP49354 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTAP49354 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTAP49354 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNTAP49354 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNTAP49354 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNTAP49354 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNTAP49354 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNTAP49354 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNTAP49354 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms