Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK8P49336 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK8P49336 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK8P49336 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK8P49336 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK8P49336 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK8P49336 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK8P49336 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK8P49336 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK8P49336 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK8P49336 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK8P49336 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK8P49336 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK8P49336 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK8P49336 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK8P49336 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK8P49336 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK8P49336 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK8P49336 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK8P49336 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK8P49336 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK8P49336 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK8P49336 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK8P49336 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK8P49336 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK8P49336 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK8P49336 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK8P49336 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK8P49336 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK8P49336 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms