Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RXRGP48443 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RXRGP48443 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RXRGP48443 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RXRGP48443 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RXRGP48443 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RXRGP48443 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RXRGP48443 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RXRGP48443 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RXRGP48443 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RXRGP48443 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RXRGP48443 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RXRGP48443 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RXRGP48443 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RXRGP48443 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RXRGP48443 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RXRGP48443 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RXRGP48443 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RXRGP48443 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RXRGP48443 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RXRGP48443 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RXRGP48443 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RXRGP48443 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RXRGP48443 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RXRGP48443 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RXRGP48443 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RXRGP48443 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms