Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABRB2P47870 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms