Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSN1S1P47710 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms