Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC4P43686 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSMC4P43686 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms