Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF4P43489 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF4P43489 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms