Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGIRP43119 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGIRP43119 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms