Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL35P42766 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL35P42766 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL35P42766 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL35P42766 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL35P42766 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL35P42766 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms