Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YER138CYER138C 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YER160CYER160C 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YJR027WYJR027W 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YML039WYML039W 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YML045WYML045W 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YMR050CYMR050C 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 ERB1YMR049C 2424 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 ROM1YGR070W 3468 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 RIF1YBR275C 5751 nt3.07□□□□□ -1.92
PDR11P40550 DYN2YDR424C 279 nt3.06□□□□□ -1.92
PDR11P40550 NSE1YLR007W 1011 nt3.06□□□□□ -1.92
PDR11P40550 TFC3YAL001C 3483 nt3.05□□□□□ -1.92
PDR11P40550 RAV1YJR033C 4074 nt3.05□□□□□ -1.92
PDR11P40550 SVL3YPL032C 2478 nt3.05□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YDR535CYDR535C 501 nt3.05□□□□□ -1.92
PDR11P40550 SLX8YER116C 825 nt3.05□□□□□ -1.92
PDR11P40550 COS4YFL062W 1140 nt3.05□□□□□ -1.92
PDR11P40550 EMP24YGL200C 612 nt3.05□□□□□ -1.92
PDR11P40550 KAP104YBR017C 2757 nt3.05□□□□□ -1.92
PDR11P40550 CBP2YHL038C 1893 nt3.05□□□□□ -1.92
PDR11P40550 NFT1YKR103W 3657 nt3.04□□□□□ -1.92
PDR11P40550 PEX4YGR133W 552 nt3.04□□□□□ -1.92
PDR11P40550 KSP1YHR082C 3090 nt3.04□□□□□ -1.92
PDR11P40550 SUC2YIL162W 1599 nt3.04□□□□□ -1.92
PDR11P40550 RSM19YNR037C 276 nt3.04□□□□□ -1.92
PDR11P40550 snR17asnR17a 333 nt3.04□□□□□ -1.92
PDR11P40550 VIP1YLR410W 3441 nt3.04□□□□□ -1.92
PDR11P40550 SPO71YDR104C 3738 nt3.03□□□□□ -1.92
PDR11P40550 GAB1YLR459W 1185 nt3.03□□□□□ -1.92
PDR11P40550 GIP3YPL137C 3831 nt3.03□□□□□ -1.92
PDR11P40550 YAR1YPL239W 603 nt3.03□□□□□ -1.92
PDR11P40550 SSF2YDR312W 1362 nt3.03□□□□□ -1.92
PDR11P40550 SIR4YDR227W 4077 nt3.03□□□□□ -1.92
PDR11P40550 ARD1YHR013C 717 nt3.02□□□□□ -1.93
PDR11P40550 SIC1YLR079W 855 nt3.02□□□□□ -1.93
PDR11P40550 YLR122CYLR122C 378 nt3.02□□□□□ -1.93
PDR11P40550 YLR428CYLR428C 345 nt3.02□□□□□ -1.93
PDR11P40550 MSN4YKL062W 1893 nt3.02□□□□□ -1.93
PDR11P40550 PEX6YNL329C 3093 nt3.02□□□□□ -1.93
PDR11P40550 CLN2YPL256C 1638 nt3.02□□□□□ -1.93
PDR11P40550 STE14YDR410C 720 nt3.02□□□□□ -1.93
PDR11P40550 ORM1YGR038W 669 nt3.02□□□□□ -1.93
PDR11P40550 ERV41YML067C 1059 nt3.02□□□□□ -1.93
PDR11P40550 IBD2YNL164C 1056 nt3.02□□□□□ -1.93
PDR11P40550 SRS2YJL092W 3525 nt3.01□□□□□ -1.93
PDR11P40550 PEX8YGR077C 1770 nt3.01□□□□□ -1.93
PDR11P40550 SIP18YMR175W 240 nt3.01□□□□□ -1.93
PDR11P40550 RAS1YOR101W 930 nt3.01□□□□□ -1.93
PDR11P40550 RRM3YHR031C 2172 nt2.99□□□□□ -1.93
PDR11P40550 YJR098CYJR098C 1971 nt2.99□□□□□ -1.93
PDR11P40550 RPS23AYGR118W 438 nt2.99□□□□□ -1.93
PDR11P40550 RPC17YJL011C 486 nt2.99□□□□□ -1.93
PDR11P40550 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.99□□□□□ -1.93
PDR11P40550 REH1YLR387C 1299 nt2.99□□□□□ -1.93
PDR11P40550 TVP18YMR071C 504 nt2.99□□□□□ -1.93
PDR11P40550 RPS23BYPR132W 438 nt2.99□□□□□ -1.93
PDR11P40550 GAL80YML051W 1308 nt2.99□□□□□ -1.93
PDR11P40550 MSA1YOR066W 1890 nt2.98□□□□□ -1.93
PDR11P40550 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.98□□□□□ -1.93
PDR11P40550 SEC6YIL068C 2418 nt2.98□□□□□ -1.93
PDR11P40550 ALO1YML086C 1581 nt2.98□□□□□ -1.93
PDR11P40550 KIN82YCR091W 2163 nt2.97□□□□□ -1.93
PDR11P40550 ECM29YHL030W 5607 nt2.97□□□□□ -1.93
PDR11P40550 RCY1YJL204C 2523 nt2.97□□□□□ -1.93
PDR11P40550 RCE1YMR274C 948 nt2.97□□□□□ -1.93
PDR11P40550 YPL088WYPL088W 1029 nt2.97□□□□□ -1.93
PDR11P40550 HER1YOR227W 3741 nt2.97□□□□□ -1.93
PDR11P40550 IRC20YLR247C 4671 nt2.96□□□□□ -1.94
PDR11P40550 MGM1YOR211C 2646 nt2.96□□□□□ -1.94
PDR11P40550 YOL098CYOL098C 3114 nt2.95□□□□□ -1.94
PDR11P40550 YKT6YKL196C 603 nt2.95□□□□□ -1.94
PDR11P40550 ALG14YBR070C 714 nt2.95□□□□□ -1.94
PDR11P40550 RFC5YBR087W 1065 nt2.95□□□□□ -1.94
PDR11P40550 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt2.95□□□□□ -1.94
PDR11P40550 GYP5YPL249C 2685 nt2.95□□□□□ -1.94
PDR11P40550 STE2YFL026W 1296 nt2.94□□□□□ -1.94
PDR11P40550 TFA1YKL028W 1449 nt2.94□□□□□ -1.94
PDR11P40550 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.94□□□□□ -1.94
PDR11P40550 YMR046CYMR046C 1323 nt2.94□□□□□ -1.94
PDR11P40550 MAC1YMR021C 1254 nt2.93□□□□□ -1.94
PDR11P40550 YPR053CYPR053C 456 nt2.93□□□□□ -1.94
PDR11P40550 snR3snR3 194 nt2.93□□□□□ -1.94
PDR11P40550 BRR2YER172C 6492 nt2.93□□□□□ -1.94
PDR11P40550 HSC82YMR186W 2118 nt2.93□□□□□ -1.94
PDR11P40550 ENT1YDL161W 1365 nt2.93□□□□□ -1.94
PDR11P40550 ZDS2YML109W 2829 nt2.93□□□□□ -1.94
PDR11P40550 TDA3YHR009C 1572 nt2.93□□□□□ -1.94
PDR11P40550 MIX14YDR031W 366 nt2.93□□□□□ -1.94
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