Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX2P40425 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX2P40425 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX2P40425 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PBX2P40425 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX2P40425 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX2P40425 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX2P40425 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX2P40425 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX2P40425 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PBX2P40425 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX2P40425 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX2P40425 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX2P40425 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX2P40425 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX2P40425 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX2P40425 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms