Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTRLP40313 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTRLP40313 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTRLP40313 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTRLP40313 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTRLP40313 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTRLP40313 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRLP40313 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTRLP40313 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms